Bioinformatique

Quelle que soit la prestation, le plateau technique propose le QC des données et l’alignement des séquences obtenues sur le génome de référence. Différents types de fichier sont fournis afin de visualiser les séquences dans un genome viewer tel que IGV.

Les bioinformaticiens peuvent également réaliser une analyse statistique afin de déterminer quels sont les sites enrichis dans la fraction immuno-précipitée (ChIP-seq), les gènes différentiellement exprimés (RNAseq, small RNA-seq) ou les cytosines différentiellement méthylées (RRBS).

Enfin nous pouvons contextualiser les données obtenues en mesurant la sur- ou sous-représentation de termes GO (Gene Ontology).