// Descriptif du plateau

MGX-qPCR Haut Débit (qPHD) est issu de la reconversion de la Plateforme d’Interactions Moléculaires IFR122 en 2005. Le plateau s’est progressivement équipé d’instruments aptes à réaliser de la PCR quantitative à haut débit (qPCR), ainsi que du génotypage haut débit rapide (HRM, SNP, CNV). La gamme des équipements permet notamment le pipetage robotique à très haut débit, et une importante capacité en thermocycleurs qPCR. Le plateau c’est aussi doté d’instruments de PCR digitale (dPCR). Les technologies qPCR et dPCR étant complémentaires sur de nombreux points.

// Prestations et tarifs proposés par le plateau

Ce plateau met à la disposition de ses utilisateurs l’expertise, les équipements et consommables nécessaires à l’extraction, le contrôle qualité des acides nucléiques, un automate destiné la préparation très haut-débit des mélanges réactionnels d’amplification sur microplaques 384 puits, une importante capacité en thermocycleurs qPCR, ainsi d’un passeur automatique de plaques PCR.

Le plateau ne réalise pas de prestations :

Le plateau assure une veille technologique, l’accueil et la formation de nombreux personnels (étudiants, techniciens, chercheurs) issus des communautés scientifiques montpelliéraine, nationale et internationale. Nous conseillons et assistons les utilisateurs à chacune des étapes de leurs projets (design expérimental, collection, conservation, extraction, choix techniques et design PCR, mise au point, réalisation, acquisition, analyse, interprétation, statistique).

L’ambition est d’amener les utilisateurs à la pleine autonomie de fonctionnement.

Plusieurs technologies y sont proposées :

  • qPCR temps réel, relative ou absolue sur ADN et ADNc. 4 canaux de multiplexage

  • Génotypage en point final de polymorphisme de substitution nucléotidique (SNP)

  • Génotypage HRM de polymorphisme de substitution nucléotidique (HRM-SNP)

  • Génotypage Variation de Nombre de Copies (CNV) par qPCR et ddPCR.

  • Recherche ddPCR d’allèles rares / population / mutation somatique.

  • Récupération des produits ddPCR pour séquençage ultérieur.

  • Instrument nomade qPCR de terrain.

 

Les équipements disponibles : 

Le plateau possède :

  • Retsch MM400 sample grinder.

  • Perkin/Elmer Janus : programmable vacuum manifold, or magnetic beads

  • Bioanalyzer 1200 Agilent

  • Labcyte/Beckmann Echo 525 Acoustic liquid handler

  • 5 Roche LC480 intruments + networked analysis computer

  • Roche LC Nano

  • Twister3 Agilent robotic plate loader

  • Stilla Technologies Naica droplet digital PCR System

 

Réservation des instruments :

https://grr.umontpellier.fr/login.php

Contact, inscriptions :

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Tarification :

Les utilisateurs inscrivent leurs consommations dans un registre : temps machine, réactifs, consommables. Ces consommations sont régularisées par bon de commande, selon un barème approuvé par le CNRS.

 

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