Depuis 2026, le plateau MGX-NGS renforce son expertise en proposant une nouvelle prestation de transcriptomique spatiale grâce à la technologie Visium HD de 10X Genomics. Cette solution permet une analyse hautement résolutive de l’expression des gènes dans leur contexte tissulaire, ouvrant la voie à des découvertes majeures en biologie et en médecine.
Deux approches complémentaires sont disponibles:
Visium HD WT (Whole Transcriptome):
- Basée sur des sondes spécifiques (3 paires de sondes par transcrit), cette méthode offre une sensibilité et une spécificité accrues.
- Compatibilité : tissus frais congelés, fixés ou FFPE d’humain et souris.
- Avantages : Idéale pour des études ciblées
Visium HD 3’:
- Capture les ARN poly-adénylés, permettant une analyse large du transcriptome.
- Compatibilité : tissus frais congelés sur une large gamme d’espèces
- Avantages : Adaptée aux études exploratoires ou à la découverte de nouveaux gènes d’intérêt.
Le plateau MGX-NGS intervient à partir de la réception des lames de tissus préparées par le client selon les protocoles de préparation 10X et prendra en charge ensuite la construction des banques et leur séquençage. L’équipe de bioinformaticiens du plateau pourra ensuite proposer plusieurs niveaux d’analyses allant du traitement standard jusqu’à des analyses plus approfondies (expression différentielle, etc)
N’hésitez pas à nous contacter pour plus de détails à l’adresse Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
