L’instrument dont nous disposons permet l’électrophorèse capillaire d’ADN, ARN, protéines, puis l’analyse automatisée des électrophérogrammes.

(Nous ne sommes pas équipés pour les applications cellules).

Cet instrument effectue une analyse précise et rapide de la qualité et de la quantité des ARN totaux, de la taille et de la quantité des produits de PCR, des fragments de restriction.

Le temps d’acquisition-analyse typique est de l’ordre de 30-45 min / 12 échantillons.

Le Bioanlyzer utilise des cassettes microfluidiques à usage unique (baptisées "Lab-On-Chip"), chaque cassette permet de 11 à 12 points d’analyse + un standard.

Chaque cassette ne permet qu’un seul run.

Le plateau qPCR-HD tient à la disposition des utilisateurs le kit "standard" pour l'analyse des ARN totaux avant réverse-transcription, destinés à la qPCR, la dPCR ou le RNA-SEQ:

RNA 6000 Nano ARN total et ARNm taille jusqu'à 6000 nt, Volume dépôt 1µL

Quantitative range ARN total 25–500 ng/ùl,

12 Echantillons par plaque + 1 standard

Agilent propose d'autres kits pour des usages plus spécialisés que la q/d-PCR, mais nous ne pouvons pas maintenir tous les kits à disposition.

* pour plus de sensibilité :

RNA 6000 Pico ARN total et ARNm taille jusqu'à 6000 nt, Volume dépôt 1ul

ARN total 50–5000 pg/ul ARNm 250–5000 pg/ul, 11 Echantillons / plaque, 1 standard

* pour l'analyse des produits PCR

DNA 1000 (ADN jusqu'à 1000 pb) depot 1µl

Quantitative range 0.1–50 ng/ul

Sizing range 25–1000 bpTypical sizing resolution ± 5 bp 25–100 bp± 5 % 100–500 bp± 10 % 500–1000 bpSizing accuracy ± 10 % (for ladder as sample)Sizing reproducibility 5 % CV (for ladder as sample)Quantitation accuracy 20 %* CV (for ladder as sample)Quant. reproducibility 25-500 bp: 15 % CV; 500-1000 bp: 5 % CV (for ladder as sample)12 Echantillon / plaque

* pour le contrôle des librairies NGS : DNA High Sensitivity

* pour l'électrophorèse de protéines

* pour l'analyse des miRNA